アカダイコン色素の原料となるアカダイコンはアブラナ科ダイコン属に属し、原産地は地中海から中央アジアとされています。古代エジプトでは紀元前2500年頃に既に食されていた記録があり、日本でも平安時代中期の著書「和名類聚抄(934(承平4)年)」にダイコンの記載があるほか、源氏物語の注釈書である「河海抄(1362(康安2)年)」に春の七草として「芹（セリ）、なづな（ペンペングサ）、御形（ハハコグサ）、はこべら（ハコベ）、仏の座（タビラコ）、すずな（カブ）、すずしろ（ダイコン）、これぞ七草」との記載があり、最も古くから親しまれてきた野菜の一つとも言えます。食用としての利用の他、消化不良や扁桃痛に対して民間療法的に用いられた例もあります。
　基本的には皮部、内部共に白色ですが、中国には「紅心大根」のような皮部が白~緑色（青首）で内部が赤色のダイコンがあります。現在では更にアカダイコンの育種が進み、皮部、内部共に赤い「紅くるり」が日本の種苗メーカーにより開発され、アントシアニン量が青首大根の約3倍、抗酸化力も約10倍と優れた特徴を持ち、サラダの彩り用として最近目にすることも多くなっています。

アカダイコン色素にはペラルゴニジンを骨格とした誘導体とシアニジンを骨格とした誘導体があり、それぞれにフェルラ酸やカフェ酸、パラクマル酸などの芳香族有機酸でアシル化されたアシル化アントシアニンとして存在しています。ペラルゴニジンは橙赤色、シアニジンは紫赤色を呈するため、前者の割合が多いとアカダイコン色素の色調の特徴である橙赤色、後者の割合が多いとは紫赤色を呈することが知られています。アカダイコン色素に用いられるのは、ペラルゴニジンを中心とした、特徴的な朱赤色を呈するアカダイコンが主に使われています。(右図)。